Пациенты с пародонтитом зачастую имеют пародонтальные карманы из-за чего зубной налет и камень скапливаются в большом количестве, десна воспалена, имеется кровоточивость, а иногда и гноетечение. Такая чистка занимает больше времени, часто может потребоваться анестезия или использование антисептических повязок для устранения воспаления. Пародонтолог убирает поддесневые зубные отложения, которые не видны невооруженным глазом, делает особый акцент на домашнем уходе, может назначить антибиотикотерапию при необходимости.